1. 신균주 잔토모나스 말토필리아(Xanthomonas maltophilia) YL-37과 이로부터 생산되는 신규 알카리성 단백질 분해효소 (특허1995-9600)
2. 신균주 캔디다 트로피카리스(Candida tropicalis) (KCTC 8687P) (특허1995-37339)
3. 신균주 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida) Bu34 (KCTC 8719P)와 이를 이용한 오염토양의 처리방법 (특허1996-4305)
4. 미생물 흡착여재 및 이를 이용한 폐수처리 방법 (특허1995-50319)
5. 재조합내열성 β-타이로시네이즈를 이용하여 고농도페놀함유 산업용폐수로부터 페놀을 유용 아미노산으로 전환하여 제거하는 방법 (특허1995-20071)
6. 생물계 응집제를 생산하는 바실러스(Bacillus) 균주 및 이를 이용한 폐수처리 방법(특허1995-34201)
7. 생물막 폐수처리용 메디아 및 폐수처리 방법 (특허1995-39320)
8. 유화활성 능력을 보유한 균주 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) C9 (특허1995-61500)
9. 유화활성 능력을 보유한 균주 노카르디아 속(Nocardia sp.) H17 (특허1995-69441)
10. 유화활성 능력을 보유한 균주 엔테로박터 속(Enterobacter sp.) F6 (특허1995-69442)
11. 유화활성 능력을 보유한 균주 노카르디아 속(Nocardia sp.) H17-1 (특허1995?69443)
12. 유화활성 능력을 보유한 균주 아시네토박터 속(Acinetobacter sp.) (특허1995-69444)
13. 페스탈로티옵시스속 균주 및 동균주로부터 생산되는 생물고분자 응집제 (특허1996-38571)
14. 신균주 바실러스속 폴리믹사 에이49(Bacillus polymyxa A49)와 이로부터 생산된 다당류 에이49폴 (특허1997-23579)
15. 조혈 촉진작용, 골수 방어작용, 암세포 살해 면역세포생성작용 및 방사선 민감작용이 우수한 인삼 다당체 (특허2000-49173)
16. 면역 증강 효과가 있는 인삼다당체 "진산“ (특허1993-28166)
17. 신균주 클레브시엘라속 미생물 Bu1 (KCTC 8852P)과 이를 이용한 폐목재의 처리방법 (특허1998-20706)
18. 미세조류로부터 탄화수소를 추출하는 방법 (특허1998-20707)
19. 오폐수 정화용 미생물 고정화 담체 제조방법 및 이로부터 제조된 미생물 고정화 담체 (특허2000-18574)
20. 격자형 오일펜스 (특허2000-11991)
21. 미생물유래 다당류를 이용한 미생물 코팅방법 (특허2000-17801)
22. 미생물을 이용한 사료첨가제 제조방법 및 이에 따라 제조된 사료첨가제 (특허2000-26868)
23. 열 및 산에 안정한 새로운 유산균 락토바실러스 헬베티쿠스 BRD-001 및 고농도 배양방법 (특허2000-26869)
24. 바실러스 속 신균주 BRD-54 (KCTC10183BP) 및 본 균주가 생산하는 혈전분해능을 갖는 효소단백질 생산방법 (특허2002-22551)
25. 오레오바시디움 속 신균주 BRD-109(기탁번호:KCTC 10182P) 및 본 균주가 생산하는 베타-글루칸 생산방법 (특허2002-34830)
26. 음식물쓰레기 발효소멸화 능력을 보유한 신규한 균주 바실러스 서브틸리스 BRD-F4B 및 이를 이용한 음식물쓰레기의 발효소멸화용 미생물제제 (특허2002-45043)
27. 음식물쓰레기 발효소멸화 능력을 보유한 신규한 균주 바실러스 서브틸리스 BRD-007 및 이를 이용한 음식물쓰레기의 발효소멸화용 미생물제제 (특허2002-45044)
28. 음식물쓰레기의 발효소멸화 능력을 보유한 신규한 균주 세라티아속 서브틸러스 BRD-N1903 및 이를 이용한 음식물쓰레기의 발효소멸화용 미생물제제 (특허2002-45045)
29. 스트렙토미세스 나탈렌시스로부터 나타마이신의 생산방법 (특허2002-76640)
30. 나타마이신의 정제방법 (특허2002-76641)
31. 스트렙토마이세스 속 균주 유래의 나타마이신 생합성 제어단백질 및 이를 코딩하는 유전자의 염기서열(특허2003-40918)
32. 신균주 캔디다속 SY16 및 이로부터 생산되는 계면활성제 (특허1999-31104)
33. 미세조류 응집제를 생산하는 Paenibacillus polymixa KCTC 0766BP) (특허2000-24048)
34. 남은 음식물의 습식발효 사료화 능력을 보유한 균주 바실러스 아밀로리키페이시엔스 (특허2001-37990)
35. 남은 음식물의 습식발효 사료화 능력을 보유한 균주 바실러스 트링기엔시스 (특허2001-37991)
36. 남은 음식물의 습식발효 사료화 능력을 보유한 균주 바실러스 세레우스(Bacillus cereus) 엔케이 204 (KCTC 18084P) (특허2001-37992)
37. 남은 음식물의 습식발효 사료화 능력을 보유한 균주 알칼리지네스속(Alcaligenes sp.) 엔케이 306 (KCTC 18082P) (특허2001-37993)